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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.175473Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 206 / 3316537 132 / 2498449 2311 / 114162531 3812 / 109592465 206 / 3316537 132 / 2498449 2311 / 114162531 3812 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 4 / 57865 --   2 / 16077 4 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     5 / 5047110 7 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 5 / 5047110 7 / 4978364
brain 10 / 506301 13 / 200215 68 / 729526 1613 / 4997811 10 / 506301 13 / 200215 68 / 729526 1613 / 4997811
cartilage   3 / 37226 -- 44 / 778035 0 / 15965 3 / 37226 -- 44 / 778035
cerebellum 4 / 90353   11 / 90885 155 / 1495938 4 / 90353 0 / 0 11 / 90885 155 / 1495938
cerebrum 8 / 198932   -- -- 8 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 15 / 151167 16 / 98089 46 / 643586 3 / 26551 15 / 151167 16 / 98089 46 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 10 / 128826 1 / 46440 3 / 85898 307 / 12434232 10 / 128826 1 / 46440 3 / 85898 307 / 12434232
gastrointestinal tract   1 / 12721   -- 0 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 7 / 76442   52 / 83063 -- 7 / 76442 0 / 1 52 / 83063 --
kidney 1 / 106627 3 / 89898 3 / 155372 1 / 100281 1 / 106627 3 / 89898 3 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 2 / 107249 2 / 66308 12 / 214987 2 / 96846 2 / 107249 2 / 66308 12 / 214987
lung 20 / 128150 14 / 170663 27 / 159917 11 / 159059 20 / 128150 14 / 170663 27 / 159917 11 / 159059
lymph node     139 / 5278419 4 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 139 / 5278419 4 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553 5 / 104307 267 / 43166038 778 / 30312656 4 / 46553 5 / 104307 267 / 43166038 778 / 30312656
muscle 39 / 74039 1 / 27691 101 / 107836 7 / 61270 39 / 74039 1 / 27691 101 / 107836 7 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 8 / 89988 7 / 94887 13 / 179472 1 / 11462 8 / 89988 7 / 94887 13 / 179472
pancreas 1 / 7237 5 / 74930 19 / 85728 9 / 189999 1 / 7237 5 / 74930 19 / 85728 9 / 189999
pancreatic islet 8 / 96524 15 / 30072 -- -- 8 / 96524 15 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 6 / 241088   2 / 207348 -- 6 / 241088 0 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 21 / 276455   -- -- 21 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993   20 / 266949 45 / 491794 6 / 79993 0 / 107080 20 / 266949 45 / 491794
retina 1 / 29438 -- 121 / 820326 11 / 88490 1 / 29438 -- 121 / 820326 11 / 88490
salivary gland 1 / 2490 6 / 10368 -- -- 1 / 2490 6 / 10368 -- --
skin 7 / 73633   291 / 26905847 565 / 34522313 7 / 73633 0 / 125377 291 / 26905847 565 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 71 / 6230144 -- -- -- 71 / 6230144 --
stomach   2 / 65644 18 / 124767 68 / 448716 0 / 26641 2 / 65644 18 / 124767 68 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 14 / 143630 3 / 100058 -- 80 / 12372003 14 / 143630 3 / 100058 -- 80 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 1 / 32606 8 / 115938 35 / 124664 1 / 11737 1 / 32606 8 / 115938 35 / 124664
uncharacterized tissue 12 / 207932 16 / 479819 4 / 21833 1 / 51729 12 / 207932 16 / 479819 4 / 21833 1 / 51729
uterus 6 / 38063 6 / 133582 790 / 10193077 -- 6 / 38063 6 / 133582 790 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 248 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 248 / 13135050 --
white blood cells -- -- 18 / 846268 -- -- -- 18 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --