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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.173894Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 110 / 3316537 67 / 2498449 981 / 114162531 1553 / 109592465 110 / 3316537 67 / 2498449 981 / 114162531 1553 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   5 / 57865 -- 1 / 83577 0 / 16077 5 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow     6 / 5047110 2 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 6 / 5047110 2 / 4978364
brain 24 / 506301 9 / 200215 9 / 729526 56 / 4997811 24 / 506301 9 / 200215 9 / 729526 56 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 72 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 72 / 778035
cerebellum 4 / 90353     5 / 1495938 4 / 90353 0 / 0 0 / 90885 5 / 1495938
cerebrum 6 / 198932   -- -- 6 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon     4 / 98089 7 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 4 / 98089 7 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 8 / 128826 1 / 46440 28 / 85898   8 / 128826 1 / 46440 28 / 85898 0 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 3 / 106627 6 / 89898 2 / 155372 7 / 100281 3 / 106627 6 / 89898 2 / 155372 7 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 4 / 107249 1 / 66308 3 / 214987 1 / 96846 4 / 107249 1 / 66308 3 / 214987
lung 4 / 128150 1 / 170663     4 / 128150 1 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node 2 / 62650   200 / 5278419 77 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 200 / 5278419 77 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 3 / 104307 18 / 43166038 823 / 30312656 3 / 46553 3 / 104307 18 / 43166038 823 / 30312656
muscle 1 / 74039   1 / 107836 3 / 61270 1 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 3 / 61270
nervous 6 / 10333   -- -- 6 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 2 / 89988 1 / 94887 2 / 179472 2 / 11462 2 / 89988 1 / 94887 2 / 179472
pancreas   5 / 74930   4 / 189999 0 / 7237 5 / 74930 0 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet 15 / 96524   -- -- 15 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 9 / 241088   1 / 207348 -- 9 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 6 / 276455   -- -- 6 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     3 / 266949 2 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 3 / 266949 2 / 491794
retina   -- 58 / 820326   0 / 29438 -- 58 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 4 / 73633   246 / 26905847 253 / 34522313 4 / 73633 0 / 125377 246 / 26905847 253 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 4 / 52939   -- -- 4 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 29 / 6230144 -- -- -- 29 / 6230144 --
stomach   1 / 65644   1 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis   6 / 100058 -- 235 / 12372003 0 / 143630 6 / 100058 -- 235 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 5 / 207932 15 / 479819     5 / 207932 15 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   5 / 133582 296 / 10193077 -- 0 / 38063 5 / 133582 296 / 10193077 --
vascular   -- 53 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 53 / 13135050 --
white blood cells -- -- 25 / 846268 -- -- -- 25 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --