Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.172982Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 60 / 3316537 5 / 2498449 2833 / 114162531 6544 / 109592465 60 / 3316537 5 / 2498449 2833 / 114162531 6544 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   6 / 5047110   1 / 14774 0 / 29891 6 / 5047110 0 / 4978364
brain 32 / 506301 2 / 200215 38 / 729526 682 / 4997811 32 / 506301 2 / 200215 38 / 729526 682 / 4997811
cartilage     -- 56 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 56 / 778035
cerebellum       43 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 43 / 1495938
cerebrum 23 / 198932   -- -- 23 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon       5 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 5 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 1 / 128826   6 / 85898 623 / 12434232 1 / 128826 0 / 46440 6 / 85898 623 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart     5 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 5 / 83063 --
kidney   2 / 89898 4 / 155372 1 / 100281 0 / 106627 2 / 89898 4 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver       3 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 3 / 214987
lung     7 / 159917 11 / 159059 0 / 128150 0 / 170663 7 / 159917 11 / 159059
lymph node     135 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 135 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     1380 / 43166038 1706 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 1380 / 43166038 1706 / 30312656
muscle       3 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 3 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     1 / 94887 11 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 11 / 179472
pancreas       14 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 14 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta     13 / 207348 -- 0 / 241088 0 / 39531 13 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     2 / 266949 1 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 2 / 266949 1 / 491794
retina   --     0 / 29438 -- 0 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     368 / 26905847 3100 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 368 / 26905847 3100 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 490 / 6230144 -- -- -- 490 / 6230144 --
stomach     5 / 124767 26 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 5 / 124767 26 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis   1 / 100058 -- 249 / 12372003 0 / 143630 1 / 100058 -- 249 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     2 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 2 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932     8 / 51729 2 / 207932 0 / 479819 0 / 21833 8 / 51729
uterus     11 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 11 / 10193077 --
vascular   -- 14 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 14 / 13135050 --
white blood cells -- -- 346 / 846268 -- -- -- 346 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --