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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.171626Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 894 / 3316537 685 / 2498449 19381 / 114162531 22092 / 109592465 894 / 3316537 685 / 2498449 19381 / 114162531 22092 / 109592465
adrenal cortex -- 5 / 9928 -- -- -- 5 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 19 / 57865 -- 2 / 83577 3 / 16077 19 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow 6 / 14774 18 / 29891 2826 / 5047110 1470 / 4978364 6 / 14774 18 / 29891 2826 / 5047110 1470 / 4978364
brain 87 / 506301 34 / 200215 240 / 729526 1698 / 4997811 87 / 506301 34 / 200215 240 / 729526 1698 / 4997811
cartilage 2 / 15965 10 / 37226 -- 261 / 778035 2 / 15965 10 / 37226 -- 261 / 778035
cerebellum 16 / 90353   14 / 90885 432 / 1495938 16 / 90353 0 / 0 14 / 90885 432 / 1495938
cerebrum 33 / 198932   -- -- 33 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 5 / 44577 -- -- 1 / 3888 5 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 16 / 151167 6 / 98089 61 / 643586 2 / 26551 16 / 151167 6 / 98089 61 / 643586
ear 4 / 16130 -- -- -- 4 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 48 / 246043   -- -- 48 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 6 / 19564 3 / 2857 -- -- 6 / 19564 3 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 21 / 128826 6 / 46440 25 / 85898 3139 / 12434232 21 / 128826 6 / 46440 25 / 85898 3139 / 12434232
gastrointestinal tract 8 / 28803 1 / 12721 3 / 45908 -- 8 / 28803 1 / 12721 3 / 45908 --
heart 21 / 76442   33 / 83063 -- 21 / 76442 0 / 1 33 / 83063 --
kidney 27 / 106627 22 / 89898 26 / 155372 8 / 100281 27 / 106627 22 / 89898 26 / 155372 8 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 47 / 96846 39 / 107249 8 / 66308 21 / 214987 47 / 96846 39 / 107249 8 / 66308 21 / 214987
lung 51 / 128150 20 / 170663 35 / 159917 19 / 159059 51 / 128150 20 / 170663 35 / 159917 19 / 159059
lymph node 3 / 62650 6 / 27007 696 / 5278419 905 / 4863489 3 / 62650 6 / 27007 696 / 5278419 905 / 4863489
lymphoreticular 3 / 17836 3 / 44303 -- -- 3 / 17836 3 / 44303 -- --
mammary gland 11 / 46553 12 / 104307 5186 / 43166038 5052 / 30312656 11 / 46553 12 / 104307 5186 / 43166038 5052 / 30312656
muscle 56 / 74039 5 / 27691 16 / 107836 5 / 61270 56 / 74039 5 / 27691 16 / 107836 5 / 61270
nervous 4 / 10333   -- -- 4 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 10 / 89988 53 / 94887 28 / 179472 1 / 11462 10 / 89988 53 / 94887 28 / 179472
pancreas   11 / 74930 9 / 85728 22 / 189999 0 / 7237 11 / 74930 9 / 85728 22 / 189999
pancreatic islet 40 / 96524 26 / 30072 -- -- 40 / 96524 26 / 30072 -- --
parathyroid   11 / 20557 -- -- 0 / 24 11 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891 1 / 645 -- -- 3 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 5 / 13260 3 / 1358 -- -- 5 / 13260 3 / 1358 -- --
placenta 46 / 241088 8 / 39531 67 / 207348 -- 46 / 241088 8 / 39531 67 / 207348 --
pooled tissue 67 / 276455   -- -- 67 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 27 / 79993 25 / 107080 94 / 266949 131 / 491794 27 / 79993 25 / 107080 94 / 266949 131 / 491794
retina 8 / 29438 -- 245 / 820326 18 / 88490 8 / 29438 -- 245 / 820326 18 / 88490
salivary gland   6 / 10368 -- -- 0 / 2490 6 / 10368 -- --
skin 8 / 73633 32 / 125377 3512 / 26905847 5466 / 34522313 8 / 73633 32 / 125377 3512 / 26905847 5466 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 873 / 6230144 -- -- -- 873 / 6230144 --
stomach   7 / 65644 24 / 124767 77 / 448716 0 / 26641 7 / 65644 24 / 124767 77 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 37 / 143630 40 / 100058 -- 3205 / 12372003 37 / 143630 40 / 100058 -- 3205 / 12372003
thymus 2 / 4478   -- -- 2 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 2 / 32606 80 / 115938 54 / 124664 1 / 11737 2 / 32606 80 / 115938 54 / 124664
uncharacterized tissue 160 / 207932 243 / 479819 9 / 21833 18 / 51729 160 / 207932 243 / 479819 9 / 21833 18 / 51729
uterus 5 / 38063 34 / 133582 2398 / 10193077 -- 5 / 38063 34 / 133582 2398 / 10193077 --
vascular 22 / 46250 -- 2836 / 13135050 -- 22 / 46250 -- 2836 / 13135050 --
white blood cells -- -- 67 / 846268 -- -- -- 67 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --