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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.171596Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 94 / 3316537 143 / 2498449 14593 / 114162531 1064 / 109592465 94 / 3316537 143 / 2498449 14593 / 114162531 1064 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     -- 1 / 83577 0 / 16077 0 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow       5 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 5 / 4978364
brain 4 / 506301 2 / 200215 4 / 729526 62 / 4997811 4 / 506301 2 / 200215 4 / 729526 62 / 4997811
cartilage     -- 28 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 28 / 778035
cerebellum       29 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 29 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 20 / 151167 18 / 98089 110 / 643586 1 / 26551 20 / 151167 18 / 98089 110 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 17 / 246043   -- -- 17 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 7 / 128826 1 / 46440 4 / 85898 46 / 12434232 7 / 128826 1 / 46440 4 / 85898 46 / 12434232
gastrointestinal tract   2 / 12721   -- 0 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 7 / 106627 3 / 89898 2 / 155372   7 / 106627 3 / 89898 2 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 4 / 107249 2 / 66308 14 / 214987 5 / 96846 4 / 107249 2 / 66308 14 / 214987
lung 6 / 128150 10 / 170663 5 / 159917 5 / 159059 6 / 128150 10 / 170663 5 / 159917 5 / 159059
lymph node   3 / 27007 5 / 5278419 2 / 4863489 0 / 62650 3 / 27007 5 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 5 / 104307 14053 / 43166038 358 / 30312656 3 / 46553 5 / 104307 14053 / 43166038 358 / 30312656
muscle 1 / 74039   1 / 107836 1 / 61270 1 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   14 / 89988 8 / 94887 4 / 179472 0 / 11462 14 / 89988 8 / 94887 4 / 179472
pancreas   32 / 74930 13 / 85728 29 / 189999 0 / 7237 32 / 74930 13 / 85728 29 / 189999
pancreatic islet 12 / 96524   -- -- 12 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 8 / 241088   1 / 207348 -- 8 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 10 / 276455   -- -- 10 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   3 / 107080 2 / 266949 29 / 491794 0 / 79993 3 / 107080 2 / 266949 29 / 491794
retina   -- 5 / 820326   0 / 29438 -- 5 / 820326 0 / 88490
salivary gland 1 / 2490   -- -- 1 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 6 / 73633 9 / 125377 172 / 26905847 218 / 34522313 6 / 73633 9 / 125377 172 / 26905847 218 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 28 / 6230144 -- -- -- 28 / 6230144 --
stomach   7 / 65644 4 / 124767 47 / 448716 0 / 26641 7 / 65644 4 / 124767 47 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630   -- 76 / 12372003 1 / 143630 0 / 100058 -- 76 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     3 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 3 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 23 / 479819 1 / 21833   2 / 207932 23 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus   3 / 133582 37 / 10193077 -- 0 / 38063 3 / 133582 37 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 222 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 222 / 13135050 --
white blood cells -- -- 3 / 846268 -- -- -- 3 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --