Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.169182Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 153 / 3316537 53 / 2498449 742 / 114162531 6362 / 109592465 153 / 3316537 53 / 2498449 742 / 114162531 6362 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     18 / 5047110 35 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 18 / 5047110 35 / 4978364
brain 72 / 506301 14 / 200215 200 / 729526 92 / 4997811 72 / 506301 14 / 200215 200 / 729526 92 / 4997811
cartilage     -- 1 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 1 / 778035
cerebellum 2 / 90353     247 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 0 / 90885 247 / 1495938
cerebrum 17 / 198932   -- -- 17 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 2 / 151167   3 / 643586 2 / 26551 2 / 151167 0 / 98089 3 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 13 / 128826 10 / 46440 3 / 85898 5534 / 12434232 13 / 128826 10 / 46440 3 / 85898 5534 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 2 / 106627     1 / 100281 2 / 106627 0 / 89898 0 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   2 / 107249   2 / 214987 0 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 1 / 128150 1 / 170663     1 / 128150 1 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node 9 / 62650   68 / 5278419 16 / 4863489 9 / 62650 0 / 27007 68 / 5278419 16 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 42 / 43166038 153 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 42 / 43166038 153 / 30312656
muscle 1 / 74039       1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     1 / 94887   0 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 0 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta     2 / 207348 -- 0 / 241088 0 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 3 / 276455   -- -- 3 / 276455 0 / 0 -- --
prostate         0 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina 4 / 29438 -- 47 / 820326 19 / 88490 4 / 29438 -- 47 / 820326 19 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     104 / 26905847 181 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 104 / 26905847 181 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 80 / 6230144 -- -- -- 80 / 6230144 --
stomach   2 / 65644   4 / 448716 0 / 26641 2 / 65644 0 / 124767 4 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 8 / 143630 6 / 100058 -- 74 / 12372003 8 / 143630 6 / 100058 -- 74 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 2 / 32606     1 / 11737 2 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 14 / 207932 12 / 479819     14 / 207932 12 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     61 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 61 / 10193077 --
vascular   -- 102 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 102 / 13135050 --
white blood cells -- -- 12 / 846268 -- -- -- 12 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --