Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.165575Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 44 / 3316537 46 / 2498449 132 / 114162531 133 / 109592465 44 / 3316537 46 / 2498449 132 / 114162531 133 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   2 / 57865 -- 1 / 83577 0 / 16077 2 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow       4 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 4 / 4978364
brain 4 / 506301 3 / 200215 6 / 729526 28 / 4997811 4 / 506301 3 / 200215 6 / 729526 28 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 6 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum 1 / 90353     4 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 4 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon   4 / 151167   3 / 643586 0 / 26551 4 / 151167 0 / 98089 3 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye   4 / 46440   11 / 12434232 0 / 128826 4 / 46440 0 / 85898 11 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   2 / 89898     0 / 106627 2 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846       1 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 2 / 128150 2 / 170663     2 / 128150 2 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node 5 / 62650 1 / 27007 8 / 5278419 6 / 4863489 5 / 62650 1 / 27007 8 / 5278419 6 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 54 / 43166038 35 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 54 / 43166038 35 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462     1 / 179472 1 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas 3 / 7237 4 / 74930     3 / 7237 4 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088   1 / 207348 -- 3 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 5 / 276455   -- -- 5 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 2 / 107080 1 / 266949 3 / 491794 2 / 79993 2 / 107080 1 / 266949 3 / 491794
retina   -- 4 / 820326   0 / 29438 -- 4 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   2 / 125377 32 / 26905847 31 / 34522313 0 / 73633 2 / 125377 32 / 26905847 31 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 3 / 6230144 -- -- -- 3 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 7 / 65644     2 / 26641 7 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630   --   4 / 143630 0 / 100058 -- 0 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 7 / 479819     1 / 207932 7 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 2 / 38063 1 / 133582 14 / 10193077 -- 2 / 38063 1 / 133582 14 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 5 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 5 / 13135050 --
white blood cells -- -- 4 / 846268 -- -- -- 4 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --