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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.16349Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 207 / 3316537 187 / 2498449 1040 / 114162531 1262 / 109592465 207 / 3316537 187 / 2498449 1040 / 114162531 1262 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   2 / 29891   1 / 4978364 0 / 14774 2 / 29891 0 / 5047110 1 / 4978364
brain 37 / 506301 3 / 200215 12 / 729526 66 / 4997811 37 / 506301 3 / 200215 12 / 729526 66 / 4997811
cartilage 1 / 15965 4 / 37226 -- 4 / 778035 1 / 15965 4 / 37226 -- 4 / 778035
cerebellum 5 / 90353   2 / 90885 10 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 2 / 90885 10 / 1495938
cerebrum 8 / 198932   -- -- 8 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   7 / 44577 -- -- 0 / 3888 7 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 7 / 151167   11 / 643586 1 / 26551 7 / 151167 0 / 98089 11 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 12 / 246043   -- -- 12 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 11 / 128826     189 / 12434232 11 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 189 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721   -- 1 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 7 / 76442     -- 7 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 8 / 106627 10 / 89898 1 / 155372 1 / 100281 8 / 106627 10 / 89898 1 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 5 / 107249   2 / 214987 1 / 96846 5 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 14 / 128150 11 / 170663 1 / 159917 2 / 159059 14 / 128150 11 / 170663 1 / 159917 2 / 159059
lymph node 7 / 62650 8 / 27007 47 / 5278419 18 / 4863489 7 / 62650 8 / 27007 47 / 5278419 18 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553 4 / 104307 417 / 43166038 320 / 30312656 4 / 46553 4 / 104307 417 / 43166038 320 / 30312656
muscle 1 / 74039 4 / 27691   1 / 61270 1 / 74039 4 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   4 / 89988 3 / 94887 6 / 179472 0 / 11462 4 / 89988 3 / 94887 6 / 179472
pancreas   7 / 74930   6 / 189999 0 / 7237 7 / 74930 0 / 85728 6 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524 4 / 30072 -- -- 4 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 15 / 241088 3 / 39531 7 / 207348 -- 15 / 241088 3 / 39531 7 / 207348 --
pooled tissue 16 / 276455   -- -- 16 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 9 / 107080 4 / 266949 9 / 491794 6 / 79993 9 / 107080 4 / 266949 9 / 491794
retina 3 / 29438 -- 7 / 820326   3 / 29438 -- 7 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 3 / 73633 4 / 125377 173 / 26905847 357 / 34522313 3 / 73633 4 / 125377 173 / 26905847 357 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 104 / 6230144 -- -- -- 104 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 4 / 65644 3 / 124767 5 / 448716 1 / 26641 4 / 65644 3 / 124767 5 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 20 / 143630 6 / 100058 -- 252 / 12372003 20 / 143630 6 / 100058 -- 252 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 1 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 1 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 8 / 207932 38 / 479819 1 / 21833   8 / 207932 38 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus 2 / 38063 33 / 133582 124 / 10193077 -- 2 / 38063 33 / 133582 124 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 129 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 129 / 13135050 --
white blood cells -- -- 4 / 846268 -- -- -- 4 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --