Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.162717Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 22 / 3316537 90 / 2498449 720 / 114162531 128 / 109592465 22 / 3316537 90 / 2498449 720 / 114162531 128 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     2 / 5047110 4 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 2 / 5047110 4 / 4978364
brain 2 / 506301 15 / 200215   6 / 4997811 2 / 506301 15 / 200215 0 / 729526 6 / 4997811
cartilage 1 / 15965   --   1 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 1 / 90353     15 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 15 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 6 / 151167 1 / 98089 8 / 643586 1 / 26551 6 / 151167 1 / 98089 8 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 1 / 128826       1 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 0 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney         0 / 106627 0 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   2 / 107249     0 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung   5 / 170663     0 / 128150 5 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node     2 / 5278419 10 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 2 / 5278419 10 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   5 / 104307 676 / 43166038 13 / 30312656 0 / 46553 5 / 104307 676 / 43166038 13 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462   1 / 94887 2 / 179472 1 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 2 / 179472
pancreas     1 / 85728   0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta   16 / 39531 1 / 207348 -- 0 / 241088 16 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 2 / 276455   -- -- 2 / 276455 0 / 0 -- --
prostate         0 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina   --     0 / 29438 -- 0 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 10 / 26905847 4 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 10 / 26905847 4 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 10 / 6230144 -- -- -- 10 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 16 / 65644   2 / 448716 2 / 26641 16 / 65644 0 / 124767 2 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 64 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 64 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 8 / 207932 19 / 479819     8 / 207932 19 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     6 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 6 / 10193077 --
vascular   -- 10 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 10 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --