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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.155597Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 174 / 3316537 53 / 2498449 12256 / 114162531 1802 / 109592465 174 / 3316537 53 / 2498449 12256 / 114162531 1802 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 5 / 57865 -- 3 / 83577 3 / 16077 5 / 57865 -- 3 / 83577
bone marrow     20 / 5047110 87 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 20 / 5047110 87 / 4978364
brain 3 / 506301 3 / 200215 6 / 729526 169 / 4997811 3 / 506301 3 / 200215 6 / 729526 169 / 4997811
cartilage   4 / 37226 -- 24 / 778035 0 / 15965 4 / 37226 -- 24 / 778035
cerebellum       12 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 12 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888 3 / 44577 -- -- 2 / 3888 3 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 4 / 151167 2 / 98089 153 / 643586 1 / 26551 4 / 151167 2 / 98089 153 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 7 / 128826     22 / 12434232 7 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 22 / 12434232
gastrointestinal tract 5 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 -- 5 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 --
heart     127 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 127 / 83063 --
kidney   1 / 89898 1 / 155372 3 / 100281 0 / 106627 1 / 89898 1 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846   1 / 66308 6 / 214987 2 / 96846 0 / 107249 1 / 66308 6 / 214987
lung 6 / 128150 9 / 170663 74 / 159917 12 / 159059 6 / 128150 9 / 170663 74 / 159917 12 / 159059
lymph node     177 / 5278419 14 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 177 / 5278419 14 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 5 / 46553   8030 / 43166038 761 / 30312656 5 / 46553 0 / 104307 8030 / 43166038 761 / 30312656
muscle 9 / 74039   18 / 107836 2 / 61270 9 / 74039 0 / 27691 18 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 5 / 89988 1 / 94887 7 / 179472 2 / 11462 5 / 89988 1 / 94887 7 / 179472
pancreas     1 / 85728 18 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 18 / 189999
pancreatic islet 9 / 96524 2 / 30072 -- -- 9 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 20 / 241088 1 / 39531 32 / 207348 -- 20 / 241088 1 / 39531 32 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 23 / 79993   96 / 266949 25 / 491794 23 / 79993 0 / 107080 96 / 266949 25 / 491794
retina   -- 3 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 3 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 2 / 73633   2986 / 26905847 381 / 34522313 2 / 73633 0 / 125377 2986 / 26905847 381 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 12 / 6230144 -- -- -- 12 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 1 / 65644 11 / 124767 25 / 448716 3 / 26641 1 / 65644 11 / 124767 25 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 11 / 143630 1 / 100058 -- 65 / 12372003 11 / 143630 1 / 100058 -- 65 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     27 / 115938 5 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 27 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 4 / 207932 13 / 479819   7 / 51729 4 / 207932 13 / 479819 0 / 21833 7 / 51729
uterus 25 / 38063   367 / 10193077 -- 25 / 38063 0 / 133582 367 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 12 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 12 / 13135050 --
white blood cells -- -- 250 / 846268 -- -- -- 250 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --