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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.154654Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 393 / 3316537 136 / 2498449 3534 / 114162531 5091 / 109592465 393 / 3316537 136 / 2498449 3534 / 114162531 5091 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 5 / 16077 3 / 57865 -- 1 / 83577 5 / 16077 3 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 5 / 14774 2 / 29891 66 / 5047110 2 / 4978364 5 / 14774 2 / 29891 66 / 5047110 2 / 4978364
brain 26 / 506301 7 / 200215 34 / 729526 130 / 4997811 26 / 506301 7 / 200215 34 / 729526 130 / 4997811
cartilage 72 / 15965 15 / 37226 -- 65 / 778035 72 / 15965 15 / 37226 -- 65 / 778035
cerebellum     1 / 90885 11 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 11 / 1495938
cerebrum 25 / 198932 13 / 3422 -- -- 25 / 198932 13 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888   -- -- 2 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   2 / 151167     0 / 26551 2 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear 13 / 16130 -- -- -- 13 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 15 / 246043   -- -- 15 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 19 / 128826   3 / 85898 350 / 12434232 19 / 128826 0 / 46440 3 / 85898 350 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803     -- 4 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 4 / 76442   2 / 83063 -- 4 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 16 / 106627 6 / 89898 4 / 155372   16 / 106627 6 / 89898 4 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 10 / 107249   4 / 214987 1 / 96846 10 / 107249 0 / 66308 4 / 214987
lung 24 / 128150 22 / 170663 2 / 159917 2 / 159059 24 / 128150 22 / 170663 2 / 159917 2 / 159059
lymph node     76 / 5278419 5 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 76 / 5278419 5 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 7 / 46553 16 / 104307 2727 / 43166038 4289 / 30312656 7 / 46553 16 / 104307 2727 / 43166038 4289 / 30312656
muscle       1 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     2 / 94887 4 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 2 / 94887 4 / 179472
pancreas   5 / 74930   2 / 189999 0 / 7237 5 / 74930 0 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524   -- -- 3 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088   2 / 207348 -- 3 / 241088 0 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 17 / 276455   -- -- 17 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 11 / 79993 7 / 107080 3 / 266949 2 / 491794 11 / 79993 7 / 107080 3 / 266949 2 / 491794
retina 1 / 29438 -- 6 / 820326   1 / 29438 -- 6 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 38 / 73633   330 / 26905847 125 / 34522313 38 / 73633 0 / 125377 330 / 26905847 125 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 15 / 52939   -- -- 15 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 62 / 6230144 -- -- -- 62 / 6230144 --
stomach   3 / 65644   3 / 448716 0 / 26641 3 / 65644 0 / 124767 3 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 9 / 143630 8 / 100058 -- 91 / 12372003 9 / 143630 8 / 100058 -- 91 / 12372003
thymus 3 / 4478   -- -- 3 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 1 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 1 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 34 / 207932 12 / 479819   2 / 51729 34 / 207932 12 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus 5 / 38063 2 / 133582 131 / 10193077 -- 5 / 38063 2 / 133582 131 / 10193077 --
vascular 8 / 46250 -- 48 / 13135050 -- 8 / 46250 -- 48 / 13135050 --
white blood cells -- -- 34 / 846268 -- -- -- 34 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --