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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.149957Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 139 / 3316537 184 / 2498449 2024 / 114162531 3295 / 109592465 139 / 3316537 184 / 2498449 2024 / 114162531 3295 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   2 / 57865 --   0 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   6 / 29891 45 / 5047110 38 / 4978364 0 / 14774 6 / 29891 45 / 5047110 38 / 4978364
brain 5 / 506301 5 / 200215 11 / 729526 99 / 4997811 5 / 506301 5 / 200215 11 / 729526 99 / 4997811
cartilage   2 / 37226 --   0 / 15965 2 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 2 / 90353   2 / 90885 19 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 2 / 90885 19 / 1495938
cerebrum 6 / 198932   -- -- 6 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 16 / 151167 3 / 98089 15 / 643586 3 / 26551 16 / 151167 3 / 98089 15 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 11 / 246043   -- -- 11 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 5 / 128826 1 / 46440   145 / 12434232 5 / 128826 1 / 46440 0 / 85898 145 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721   -- 1 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 3 / 76442     -- 3 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 1 / 106627 2 / 89898 4 / 155372 7 / 100281 1 / 106627 2 / 89898 4 / 155372 7 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 3 / 107249   9 / 214987 5 / 96846 3 / 107249 0 / 66308 9 / 214987
lung 10 / 128150 8 / 170663 19 / 159917 7 / 159059 10 / 128150 8 / 170663 19 / 159917 7 / 159059
lymph node 8 / 62650 3 / 27007 418 / 5278419 196 / 4863489 8 / 62650 3 / 27007 418 / 5278419 196 / 4863489
lymphoreticular 3 / 17836 16 / 44303 -- -- 3 / 17836 16 / 44303 -- --
mammary gland   4 / 104307 202 / 43166038 1511 / 30312656 0 / 46553 4 / 104307 202 / 43166038 1511 / 30312656
muscle 4 / 74039   1 / 107836   4 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   11 / 89988 5 / 94887 5 / 179472 0 / 11462 11 / 89988 5 / 94887 5 / 179472
pancreas   2 / 74930   4 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524   -- -- 1 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088 1 / 39531 4 / 207348 -- 3 / 241088 1 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 4 / 276455   -- -- 4 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 4 / 107080 4 / 266949 12 / 491794 2 / 79993 4 / 107080 4 / 266949 12 / 491794
retina   -- 5 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 5 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 9 / 125377 722 / 26905847 598 / 34522313 1 / 73633 9 / 125377 722 / 26905847 598 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 23 / 52939   -- -- 23 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 208 / 6230144 -- -- -- 208 / 6230144 --
stomach   8 / 65644 6 / 124767 9 / 448716 0 / 26641 8 / 65644 6 / 124767 9 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 14 / 100058 -- 602 / 12372003 1 / 143630 14 / 100058 -- 602 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 6 / 32606 4 / 115938 13 / 124664 2 / 11737 6 / 32606 4 / 115938 13 / 124664
uncharacterized tissue 30 / 207932 47 / 479819   5 / 51729 30 / 207932 47 / 479819 0 / 21833 5 / 51729
uterus 3 / 38063 6 / 133582 128 / 10193077 -- 3 / 38063 6 / 133582 128 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 195 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 195 / 13135050 --
white blood cells -- -- 38 / 846268 -- -- -- 38 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --