Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.148677Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 376 / 3316537 268 / 2498449 1248 / 114162531 1851 / 109592465 376 / 3316537 268 / 2498449 1248 / 114162531 1851 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 3 / 57865 --   1 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 2 / 14774 10 / 29891 9 / 5047110 36 / 4978364 2 / 14774 10 / 29891 9 / 5047110 36 / 4978364
brain 131 / 506301 29 / 200215 16 / 729526 164 / 4997811 131 / 506301 29 / 200215 16 / 729526 164 / 4997811
cartilage 5 / 15965 8 / 37226 -- 6 / 778035 5 / 15965 8 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum 24 / 90353   1 / 90885 60 / 1495938 24 / 90353 0 / 0 1 / 90885 60 / 1495938
cerebrum 43 / 198932 1 / 3422 -- -- 43 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 8 / 151167   18 / 643586 2 / 26551 8 / 151167 0 / 98089 18 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 28 / 246043   -- -- 28 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 1 / 128826 6 / 46440 4 / 85898 245 / 12434232 1 / 128826 6 / 46440 4 / 85898 245 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 -- 1 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 --
heart 9 / 76442     -- 9 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 5 / 106627 8 / 89898 5 / 155372   5 / 106627 8 / 89898 5 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   3 / 107249 1 / 66308 6 / 214987 0 / 96846 3 / 107249 1 / 66308 6 / 214987
lung 19 / 128150 8 / 170663 4 / 159917   19 / 128150 8 / 170663 4 / 159917 0 / 159059
lymph node 15 / 62650 1 / 27007 105 / 5278419 41 / 4863489 15 / 62650 1 / 27007 105 / 5278419 41 / 4863489
lymphoreticular   5 / 44303 -- -- 0 / 17836 5 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 17 / 104307 34 / 43166038 432 / 30312656 1 / 46553 17 / 104307 34 / 43166038 432 / 30312656
muscle 2 / 74039 6 / 27691 2 / 107836 1 / 61270 2 / 74039 6 / 27691 2 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   5 / 89988 5 / 94887 2 / 179472 0 / 11462 5 / 89988 5 / 94887 2 / 179472
pancreas   5 / 74930   2 / 189999 0 / 7237 5 / 74930 0 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 16 / 241088 6 / 39531 5 / 207348 -- 16 / 241088 6 / 39531 5 / 207348 --
pooled tissue 18 / 276455   -- -- 18 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 4 / 107080 3 / 266949 5 / 491794 5 / 79993 4 / 107080 3 / 266949 5 / 491794
retina   -- 29 / 820326 7 / 88490 0 / 29438 -- 29 / 820326 7 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 26 / 125377 534 / 26905847 674 / 34522313 4 / 73633 26 / 125377 534 / 26905847 674 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 6 / 52939   -- -- 6 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 79 / 6230144 -- -- -- 79 / 6230144 --
stomach   13 / 65644 1 / 124767 8 / 448716 0 / 26641 13 / 65644 1 / 124767 8 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 19 / 143630 26 / 100058 -- 138 / 12372003 19 / 143630 26 / 100058 -- 138 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     7 / 115938 6 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 7 / 115938 6 / 124664
uncharacterized tissue 10 / 207932 55 / 479819     10 / 207932 55 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 1 / 38063 8 / 133582 153 / 10193077 -- 1 / 38063 8 / 133582 153 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 241 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 241 / 13135050 --
white blood cells -- -- 8 / 846268 -- -- -- 8 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --