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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.141125Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 238 / 3316537 134 / 2498449 3671 / 114162531 3775 / 109592465 238 / 3316537 134 / 2498449 3671 / 114162531 3775 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 5 / 57865 --   2 / 16077 5 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   3 / 29891 10 / 5047110 20 / 4978364 0 / 14774 3 / 29891 10 / 5047110 20 / 4978364
brain 42 / 506301 5 / 200215 13 / 729526 143 / 4997811 42 / 506301 5 / 200215 13 / 729526 143 / 4997811
cartilage   7 / 37226 -- 10 / 778035 0 / 15965 7 / 37226 -- 10 / 778035
cerebellum 1 / 90353   2 / 90885 70 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 2 / 90885 70 / 1495938
cerebrum 11 / 198932   -- -- 11 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 1 / 44577 -- -- 1 / 3888 1 / 44577 -- --
colon   6 / 151167 1 / 98089 4 / 643586 0 / 26551 6 / 151167 1 / 98089 4 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 31 / 246043   -- -- 31 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 2 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 840 / 12434232 2 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 840 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 5 / 76442     -- 5 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 12 / 106627 4 / 89898 5 / 155372   12 / 106627 4 / 89898 5 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 9 / 107249 1 / 66308 1 / 214987 5 / 96846 9 / 107249 1 / 66308 1 / 214987
lung 9 / 128150 9 / 170663 1 / 159917 3 / 159059 9 / 128150 9 / 170663 1 / 159917 3 / 159059
lymph node 14 / 62650 2 / 27007 137 / 5278419 132 / 4863489 14 / 62650 2 / 27007 137 / 5278419 132 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 103 / 43166038 871 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 103 / 43166038 871 / 30312656
muscle 5 / 74039     1 / 61270 5 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988   2 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas   2 / 74930   1 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 11 / 241088 3 / 39531 4 / 207348 -- 11 / 241088 3 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 35 / 276455   -- -- 35 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 1 / 107080 2 / 266949 2 / 491794 6 / 79993 1 / 107080 2 / 266949 2 / 491794
retina 1 / 29438 -- 13 / 820326 7 / 88490 1 / 29438 -- 13 / 820326 7 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 9 / 73633 4 / 125377 862 / 26905847 1038 / 34522313 9 / 73633 4 / 125377 862 / 26905847 1038 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 587 / 6230144 -- -- -- 587 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 1 / 65644 2 / 124767 22 / 448716 2 / 26641 1 / 65644 2 / 124767 22 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis   14 / 100058 -- 603 / 12372003 0 / 143630 14 / 100058 -- 603 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 6 / 115938 3 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 6 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue 19 / 207932 40 / 479819 1 / 21833 2 / 51729 19 / 207932 40 / 479819 1 / 21833 2 / 51729
uterus   7 / 133582 194 / 10193077 -- 0 / 38063 7 / 133582 194 / 10193077 --
vascular 8 / 46250 -- 1716 / 13135050 -- 8 / 46250 -- 1716 / 13135050 --
white blood cells -- -- 9 / 846268 -- -- -- 9 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --