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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.135646Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 218 / 3316537 165 / 2498449 2926 / 114162531 2101 / 109592465 218 / 3316537 165 / 2498449 2926 / 114162531 2101 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   2 / 57865 --   0 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 4 / 29891 251 / 5047110 430 / 4978364 1 / 14774 4 / 29891 251 / 5047110 430 / 4978364
brain 10 / 506301 7 / 200215 14 / 729526 77 / 4997811 10 / 506301 7 / 200215 14 / 729526 77 / 4997811
cartilage   5 / 37226 -- 6 / 778035 0 / 15965 5 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum 1 / 90353     18 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 18 / 1495938
cerebrum 13 / 198932   -- -- 13 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 8 / 151167 3 / 98089 1 / 643586 1 / 26551 8 / 151167 3 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 5 / 246043   -- -- 5 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 5 / 128826 1 / 46440   118 / 12434232 5 / 128826 1 / 46440 0 / 85898 118 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 1 / 12721   -- 3 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442     -- 2 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 8 / 106627 2 / 89898 2 / 155372   8 / 106627 2 / 89898 2 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 10 / 96846 1 / 107249   1 / 214987 10 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 7 / 128150 14 / 170663   4 / 159059 7 / 128150 14 / 170663 0 / 159917 4 / 159059
lymph node 41 / 62650 9 / 27007 377 / 5278419 38 / 4863489 41 / 62650 9 / 27007 377 / 5278419 38 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 8 / 44303 -- -- 1 / 17836 8 / 44303 -- --
mammary gland 5 / 46553 5 / 104307 1205 / 43166038 676 / 30312656 5 / 46553 5 / 104307 1205 / 43166038 676 / 30312656
muscle 3 / 74039       3 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   4 / 89988     0 / 11462 4 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas   6 / 74930 2 / 85728 1 / 189999 0 / 7237 6 / 74930 2 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 8 / 96524 2 / 30072 -- -- 8 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 20 / 241088 3 / 39531 2 / 207348 -- 20 / 241088 3 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 25 / 276455   -- -- 25 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 7 / 79993 3 / 107080 9 / 266949 3 / 491794 7 / 79993 3 / 107080 9 / 266949 3 / 491794
retina   -- 2 / 820326   0 / 29438 -- 2 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 1 / 125377 533 / 26905847 691 / 34522313 4 / 73633 1 / 125377 533 / 26905847 691 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 72 / 6230144 -- -- -- 72 / 6230144 --
stomach         0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 6 / 100058 -- 35 / 12372003 3 / 143630 6 / 100058 -- 35 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   3 / 32606 1 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 3 / 32606 1 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 23 / 207932 53 / 479819 1 / 21833 1 / 51729 23 / 207932 53 / 479819 1 / 21833 1 / 51729
uterus 5 / 38063 13 / 133582 90 / 10193077 -- 5 / 38063 13 / 133582 90 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 222 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 222 / 13135050 --
white blood cells -- -- 140 / 846268 -- -- -- 140 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --