Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.134665Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 190 / 3316537 56 / 2498449 871 / 114162531 1617 / 109592465 190 / 3316537 56 / 2498449 871 / 114162531 1617 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 --   0 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   2 / 29891 27 / 5047110 52 / 4978364 0 / 14774 2 / 29891 27 / 5047110 52 / 4978364
brain 78 / 506301 13 / 200215 73 / 729526 398 / 4997811 78 / 506301 13 / 200215 73 / 729526 398 / 4997811
cartilage     -- 11 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 11 / 778035
cerebellum 8 / 90353   4 / 90885 34 / 1495938 8 / 90353 0 / 0 4 / 90885 34 / 1495938
cerebrum 18 / 198932   -- -- 18 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 1 / 151167   1 / 643586 1 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 15 / 246043   -- -- 15 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 5 / 128826   3 / 85898 407 / 12434232 5 / 128826 0 / 46440 3 / 85898 407 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803     -- 2 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 5 / 76442   3 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 5 / 106627 6 / 89898 12 / 155372   5 / 106627 6 / 89898 12 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846   1 / 66308 3 / 214987 1 / 96846 0 / 107249 1 / 66308 3 / 214987
lung 5 / 128150 2 / 170663 2 / 159917 4 / 159059 5 / 128150 2 / 170663 2 / 159917 4 / 159059
lymph node     5 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 5 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   2 / 104307 441 / 43166038 229 / 30312656 0 / 46553 2 / 104307 441 / 43166038 229 / 30312656
muscle 6 / 74039 1 / 27691 4 / 107836 7 / 61270 6 / 74039 1 / 27691 4 / 107836 7 / 61270
nervous 3 / 10333   -- -- 3 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988 1 / 94887 1 / 179472 0 / 11462 1 / 89988 1 / 94887 1 / 179472
pancreas   2 / 74930     0 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 6 / 241088   4 / 207348 -- 6 / 241088 0 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 10 / 276455   -- -- 10 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993       1 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina   -- 16 / 820326 4 / 88490 0 / 29438 -- 16 / 820326 4 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   7 / 125377 36 / 26905847 408 / 34522313 0 / 73633 7 / 125377 36 / 26905847 408 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 44 / 6230144 -- -- -- 44 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 1 / 65644   7 / 448716 1 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 7 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 5 / 100058 -- 50 / 12372003 1 / 143630 5 / 100058 -- 50 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606   1 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 0 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 8 / 479819     1 / 207932 8 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 6 / 38063   27 / 10193077 -- 6 / 38063 0 / 133582 27 / 10193077 --
vascular 5 / 46250 -- 168 / 13135050 -- 5 / 46250 -- 168 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --