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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.133397Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 204 / 3316537 178 / 2498449 5731 / 114162531 7561 / 109592465 204 / 3316537 178 / 2498449 5731 / 114162531 7561 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   4 / 57865 --   0 / 16077 4 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   2 / 29891   30 / 4978364 0 / 14774 2 / 29891 0 / 5047110 30 / 4978364
brain 27 / 506301 5 / 200215 13 / 729526 166 / 4997811 27 / 506301 5 / 200215 13 / 729526 166 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 1 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 1 / 778035
cerebellum 1 / 90353     22 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 22 / 1495938
cerebrum 12 / 198932 1 / 3422 -- -- 12 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 37 / 151167 4 / 98089 16 / 643586 3 / 26551 37 / 151167 4 / 98089 16 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 15 / 246043   -- -- 15 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine   2 / 2857 -- -- 0 / 19564 2 / 2857 -- --
esophagus   5 / 17290 -- -- 0 / 270 5 / 17290 -- --
eye 6 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 207 / 12434232 6 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 207 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 -- 2 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 --
heart 4 / 76442   2 / 83063 -- 4 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 5 / 106627 6 / 89898 6 / 155372   5 / 106627 6 / 89898 6 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 7 / 107249 1 / 66308 11 / 214987 2 / 96846 7 / 107249 1 / 66308 11 / 214987
lung 5 / 128150 5 / 170663 2 / 159917   5 / 128150 5 / 170663 2 / 159917 0 / 159059
lymph node     29 / 5278419 1 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 29 / 5278419 1 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 17 / 46553 5 / 104307 578 / 43166038 1826 / 30312656 17 / 46553 5 / 104307 578 / 43166038 1826 / 30312656
muscle 7 / 74039     4 / 61270 7 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 4 / 61270
nervous 3 / 10333   -- -- 3 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   6 / 89988   4 / 179472 0 / 11462 6 / 89988 0 / 94887 4 / 179472
pancreas 1 / 7237 5 / 74930   6 / 189999 1 / 7237 5 / 74930 0 / 85728 6 / 189999
pancreatic islet   1 / 30072 -- -- 0 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 36 / 241088 2 / 39531 24 / 207348 -- 36 / 241088 2 / 39531 24 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 8 / 79993 4 / 107080 10 / 266949 8 / 491794 8 / 79993 4 / 107080 10 / 266949 8 / 491794
retina   -- 8 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 8 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 2 / 73633 13 / 125377 2358 / 26905847 4449 / 34522313 2 / 73633 13 / 125377 2358 / 26905847 4449 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 4 / 52939   -- -- 4 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 498 / 6230144 -- -- -- 498 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 15 / 65644 5 / 124767 41 / 448716 2 / 26641 15 / 65644 5 / 124767 41 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 13 / 143630 9 / 100058 -- 763 / 12372003 13 / 143630 9 / 100058 -- 763 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   6 / 32606 3 / 115938 4 / 124664 0 / 11737 6 / 32606 3 / 115938 4 / 124664
uncharacterized tissue 7 / 207932 26 / 479819 1 / 21833 1 / 51729 7 / 207932 26 / 479819 1 / 21833 1 / 51729
uterus   7 / 133582 533 / 10193077 -- 0 / 38063 7 / 133582 533 / 10193077 --
vascular 5 / 46250 -- 1639 / 13135050 -- 5 / 46250 -- 1639 / 13135050 --
white blood cells -- -- 14 / 846268 -- -- -- 14 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --