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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.131819Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 137 / 3316537 39 / 2498449 273 / 114162531 160 / 109592465 137 / 3316537 39 / 2498449 273 / 114162531 160 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 34 / 506301 2 / 200215 3 / 729526 7 / 4997811 34 / 506301 2 / 200215 3 / 729526 7 / 4997811
cartilage   5 / 37226 -- 2 / 778035 0 / 15965 5 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum 2 / 90353       2 / 90353 0 / 0 0 / 90885 0 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   11 / 151167   1 / 643586 0 / 26551 11 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 2 / 246043   -- -- 2 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 5 / 128826   2 / 85898   5 / 128826 0 / 46440 2 / 85898 0 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 26 / 106627     1 / 100281 26 / 106627 0 / 89898 0 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 32 / 128150     9 / 159059 32 / 128150 0 / 170663 0 / 159917 9 / 159059
lymph node         0 / 62650 0 / 27007 0 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   2 / 104307 193 / 43166038 74 / 30312656 0 / 46553 2 / 104307 193 / 43166038 74 / 30312656
muscle 3 / 74039     2 / 61270 3 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 1 / 89988   1 / 179472 1 / 11462 1 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas   1 / 74930   3 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524   -- -- 6 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 6 / 241088     -- 6 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 10 / 276455   -- -- 10 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   10 / 107080 1 / 266949   0 / 79993 10 / 107080 1 / 266949 0 / 491794
retina   -- 1 / 820326   0 / 29438 -- 1 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633   61 / 26905847 37 / 34522313 1 / 73633 0 / 125377 61 / 26905847 37 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 9 / 6230144 -- -- -- 9 / 6230144 --
stomach         0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis   2 / 100058 -- 23 / 12372003 0 / 143630 2 / 100058 -- 23 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 3 / 479819     1 / 207932 3 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   2 / 133582 3 / 10193077 -- 0 / 38063 2 / 133582 3 / 10193077 --
vascular   --   -- 0 / 46250 -- 0 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --