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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.129634Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 162 / 3316537 146 / 2498449 1235 / 114162531 645 / 109592465 162 / 3316537 146 / 2498449 1235 / 114162531 645 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 4 / 57865 --   3 / 16077 4 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     7 / 5047110 45 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 7 / 5047110 45 / 4978364
brain 20 / 506301 14 / 200215 10 / 729526 80 / 4997811 20 / 506301 14 / 200215 10 / 729526 80 / 4997811
cartilage   5 / 37226 -- 23 / 778035 0 / 15965 5 / 37226 -- 23 / 778035
cerebellum 3 / 90353     15 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 0 / 90885 15 / 1495938
cerebrum 7 / 198932   -- -- 7 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 4 / 44577 -- -- 1 / 3888 4 / 44577 -- --
colon   6 / 151167 2 / 98089 13 / 643586 0 / 26551 6 / 151167 2 / 98089 13 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 13 / 246043   -- -- 13 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 8 / 128826   1 / 85898 33 / 12434232 8 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 33 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 15 / 76442   3 / 83063 -- 15 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 6 / 106627 4 / 89898 1 / 155372 1 / 100281 6 / 106627 4 / 89898 1 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   4 / 107249   2 / 214987 0 / 96846 4 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 11 / 128150 9 / 170663 4 / 159917 4 / 159059 11 / 128150 9 / 170663 4 / 159917 4 / 159059
lymph node 4 / 62650 1 / 27007 31 / 5278419 9 / 4863489 4 / 62650 1 / 27007 31 / 5278419 9 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   3 / 104307 816 / 43166038 193 / 30312656 0 / 46553 3 / 104307 816 / 43166038 193 / 30312656
muscle 3 / 74039 3 / 27691 1 / 107836   3 / 74039 3 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   6 / 89988 1 / 94887 11 / 179472 0 / 11462 6 / 89988 1 / 94887 11 / 179472
pancreas   4 / 74930 2 / 85728 5 / 189999 0 / 7237 4 / 74930 2 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524 3 / 30072 -- -- 3 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid   10 / 20557 -- -- 0 / 24 10 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 13 / 241088 3 / 39531 3 / 207348 -- 13 / 241088 3 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 10 / 276455   -- -- 10 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 4 / 107080 5 / 266949 12 / 491794 3 / 79993 4 / 107080 5 / 266949 12 / 491794
retina   -- 3 / 820326 4 / 88490 0 / 29438 -- 3 / 820326 4 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 12 / 73633 7 / 125377 68 / 26905847 112 / 34522313 12 / 73633 7 / 125377 68 / 26905847 112 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 111 / 6230144 -- -- -- 111 / 6230144 --
stomach 2 / 26641   1 / 124767 7 / 448716 2 / 26641 0 / 65644 1 / 124767 7 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 9 / 143630 1 / 100058 -- 73 / 12372003 9 / 143630 1 / 100058 -- 73 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   3 / 32606 1 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 3 / 32606 1 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 7 / 207932 43 / 479819   1 / 51729 7 / 207932 43 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 4 / 38063 4 / 133582 39 / 10193077 -- 4 / 38063 4 / 133582 39 / 10193077 --
vascular   -- 98 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 98 / 13135050 --
white blood cells -- -- 26 / 846268 -- -- -- 26 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --