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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.129452Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 89 / 3316537 49 / 2498449 89 / 114162531 329 / 109592465 89 / 3316537 49 / 2498449 89 / 114162531 329 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077   --   2 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 13 / 506301 3 / 200215   24 / 4997811 13 / 506301 3 / 200215 0 / 729526 24 / 4997811
cartilage     --   0 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum     1 / 90885 178 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 178 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   4 / 151167     0 / 26551 4 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 8 / 246043   -- -- 8 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 9 / 128826 4 / 46440 3 / 85898 85 / 12434232 9 / 128826 4 / 46440 3 / 85898 85 / 12434232
gastrointestinal tract   4 / 12721   -- 0 / 28803 4 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442     -- 1 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 6 / 106627 2 / 89898 5 / 155372   6 / 106627 2 / 89898 5 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 4 / 128150 6 / 170663     4 / 128150 6 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node     1 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 1 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 2 / 43166038 27 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 2 / 43166038 27 / 30312656
muscle 2 / 74039       2 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary       3 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 3 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524 4 / 30072 -- -- 4 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 4 / 6170 -- -- -- 4 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 6 / 241088     -- 6 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 18 / 276455   -- -- 18 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993   2 / 266949 1 / 491794 2 / 79993 0 / 107080 2 / 266949 1 / 491794
retina 3 / 29438 -- 8 / 820326 3 / 88490 3 / 29438 -- 8 / 820326 3 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     11 / 26905847   0 / 73633 0 / 125377 11 / 26905847 0 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 3 / 6230144 -- -- -- 3 / 6230144 --
stomach 1 / 26641     1 / 448716 1 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630   -- 6 / 12372003 3 / 143630 0 / 100058 -- 6 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606   1 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 0 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 7 / 479819     1 / 207932 7 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   12 / 133582 6 / 10193077 -- 0 / 38063 12 / 133582 6 / 10193077 --
vascular   -- 47 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 47 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --