Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.127675Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 137 / 3316537 72 / 2498449 2274 / 114162531 1967 / 109592465 137 / 3316537 72 / 2498449 2274 / 114162531 1967 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 3 / 57865 --   2 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 19 / 506301 11 / 200215 10 / 729526 33 / 4997811 19 / 506301 11 / 200215 10 / 729526 33 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 2 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum 4 / 90353     11 / 1495938 4 / 90353 0 / 0 0 / 90885 11 / 1495938
cerebrum 13 / 198932   -- -- 13 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 3 / 151167     1 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 11 / 246043   -- -- 11 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 1 / 128826     334 / 12434232 1 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 334 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803     -- 2 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 3 / 76442   2 / 83063 -- 3 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 6 / 106627 3 / 89898     6 / 106627 3 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 2 / 107249 1 / 66308 1 / 214987 2 / 96846 2 / 107249 1 / 66308 1 / 214987
lung 2 / 128150 2 / 170663   1 / 159059 2 / 128150 2 / 170663 0 / 159917 1 / 159059
lymph node 3 / 62650   165 / 5278419 16 / 4863489 3 / 62650 0 / 27007 165 / 5278419 16 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     35 / 43166038 215 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 35 / 43166038 215 / 30312656
muscle 2 / 74039       2 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 9 / 89988   1 / 179472 1 / 11462 9 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas   1 / 74930     0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524 1 / 30072 -- -- 2 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 15 / 241088   1 / 207348 -- 15 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 11 / 276455   -- -- 11 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 1 / 107080     4 / 79993 1 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina   -- 6 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 6 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633   1699 / 26905847 1240 / 34522313 1 / 73633 0 / 125377 1699 / 26905847 1240 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 8 / 52939   -- -- 8 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 98 / 6230144 -- -- -- 98 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 1 / 65644   1 / 448716 1 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 6 / 143630 3 / 100058 -- 111 / 12372003 6 / 143630 3 / 100058 -- 111 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 15 / 207932 23 / 479819     15 / 207932 23 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   4 / 133582 67 / 10193077 -- 0 / 38063 4 / 133582 67 / 10193077 --
vascular   -- 188 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 188 / 13135050 --
white blood cells -- -- 2 / 846268 -- -- -- 2 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --