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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.126857Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 181 / 3316537 167 / 2498449 1971 / 114162531 2777 / 109592465 181 / 3316537 167 / 2498449 1971 / 114162531 2777 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   4 / 57865 --   0 / 16077 4 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     4 / 5047110 1 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 4 / 5047110 1 / 4978364
brain 36 / 506301 7 / 200215 31 / 729526 298 / 4997811 36 / 506301 7 / 200215 31 / 729526 298 / 4997811
cartilage   3 / 37226 -- 6 / 778035 0 / 15965 3 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum 4 / 90353   8 / 90885 77 / 1495938 4 / 90353 0 / 0 8 / 90885 77 / 1495938
cerebrum 17 / 198932   -- -- 17 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 1 / 44577 -- -- 1 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 6 / 151167   4 / 643586 3 / 26551 6 / 151167 0 / 98089 4 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 8 / 246043   -- -- 8 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 16 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 830 / 12434232 16 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 830 / 12434232
gastrointestinal tract   4 / 12721   -- 0 / 28803 4 / 12721 0 / 45908 --
heart 3 / 76442   2 / 83063 -- 3 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 6 / 106627 8 / 89898 4 / 155372 1 / 100281 6 / 106627 8 / 89898 4 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   8 / 107249   1 / 214987 0 / 96846 8 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 4 / 128150 12 / 170663 5 / 159917 5 / 159059 4 / 128150 12 / 170663 5 / 159917 5 / 159059
lymph node 2 / 62650 1 / 27007 61 / 5278419 29 / 4863489 2 / 62650 1 / 27007 61 / 5278419 29 / 4863489
lymphoreticular   4 / 44303 -- -- 0 / 17836 4 / 44303 -- --
mammary gland   7 / 104307 114 / 43166038 292 / 30312656 0 / 46553 7 / 104307 114 / 43166038 292 / 30312656
muscle 3 / 74039   2 / 107836   3 / 74039 0 / 27691 2 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 1 / 89988 2 / 94887 3 / 179472 2 / 11462 1 / 89988 2 / 94887 3 / 179472
pancreas   5 / 74930   5 / 189999 0 / 7237 5 / 74930 0 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524 2 / 30072 -- -- 1 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 14 / 241088 2 / 39531   -- 14 / 241088 2 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 7 / 276455   -- -- 7 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 18 / 79993 2 / 107080 9 / 266949 7 / 491794 18 / 79993 2 / 107080 9 / 266949 7 / 491794
retina 6 / 29438 -- 57 / 820326   6 / 29438 -- 57 / 820326 0 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin   11 / 125377 720 / 26905847 806 / 34522313 0 / 73633 11 / 125377 720 / 26905847 806 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 281 / 6230144 -- -- -- 281 / 6230144 --
stomach   4 / 65644 2 / 124767 14 / 448716 0 / 26641 4 / 65644 2 / 124767 14 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 11 / 143630 15 / 100058 -- 394 / 12372003 11 / 143630 15 / 100058 -- 394 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 5 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 5 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 10 / 207932 46 / 479819   2 / 51729 10 / 207932 46 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus 4 / 38063 6 / 133582 398 / 10193077 -- 4 / 38063 6 / 133582 398 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 262 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 262 / 13135050 --
white blood cells -- -- 2 / 846268 -- -- -- 2 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --