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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.12420Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 284 / 3316537 167 / 2498449 1985 / 114162531 2076 / 109592465 284 / 3316537 167 / 2498449 1985 / 114162531 2076 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   4 / 57865 --   0 / 16077 4 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   1 / 29891 4 / 5047110 4 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 4 / 5047110 4 / 4978364
brain 55 / 506301 16 / 200215 9 / 729526 147 / 4997811 55 / 506301 16 / 200215 9 / 729526 147 / 4997811
cartilage 1 / 15965 3 / 37226 -- 6 / 778035 1 / 15965 3 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum 19 / 90353   4 / 90885 69 / 1495938 19 / 90353 0 / 0 4 / 90885 69 / 1495938
cerebrum 16 / 198932   -- -- 16 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 5 / 44577 -- -- 1 / 3888 5 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 4 / 151167   5 / 643586 1 / 26551 4 / 151167 0 / 98089 5 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 31 / 246043   -- -- 31 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 8 / 128826 1 / 46440 3 / 85898 379 / 12434232 8 / 128826 1 / 46440 3 / 85898 379 / 12434232
gastrointestinal tract   2 / 12721 3 / 45908 -- 0 / 28803 2 / 12721 3 / 45908 --
heart 2 / 76442   3 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 13 / 106627 7 / 89898 3 / 155372   13 / 106627 7 / 89898 3 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 9 / 96846 3 / 107249 2 / 66308 1 / 214987 9 / 96846 3 / 107249 2 / 66308 1 / 214987
lung 15 / 128150 6 / 170663 3 / 159917 3 / 159059 15 / 128150 6 / 170663 3 / 159917 3 / 159059
lymph node 11 / 62650   94 / 5278419 34 / 4863489 11 / 62650 0 / 27007 94 / 5278419 34 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 6 / 46553 18 / 104307 69 / 43166038 330 / 30312656 6 / 46553 18 / 104307 69 / 43166038 330 / 30312656
muscle 7 / 74039 2 / 27691   2 / 61270 7 / 74039 2 / 27691 0 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 1 / 94887 5 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 1 / 94887 5 / 179472
pancreas   1 / 74930   3 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 8 / 96524 5 / 30072 -- -- 8 / 96524 5 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 9 / 241088 3 / 39531 2 / 207348 -- 9 / 241088 3 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 21 / 276455   -- -- 21 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 15 / 79993 2 / 107080   2 / 491794 15 / 79993 2 / 107080 0 / 266949 2 / 491794
retina 2 / 29438 -- 26 / 820326 9 / 88490 2 / 29438 -- 26 / 820326 9 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 8 / 73633 3 / 125377 554 / 26905847 283 / 34522313 8 / 73633 3 / 125377 554 / 26905847 283 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 595 / 6230144 -- -- -- 595 / 6230144 --
stomach   7 / 65644 2 / 124767 3 / 448716 0 / 26641 7 / 65644 2 / 124767 3 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 11 / 100058 -- 785 / 12372003 3 / 143630 11 / 100058 -- 785 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   5 / 32606 10 / 115938 4 / 124664 0 / 11737 5 / 32606 10 / 115938 4 / 124664
uncharacterized tissue 10 / 207932 47 / 479819 1 / 21833 2 / 51729 10 / 207932 47 / 479819 1 / 21833 2 / 51729
uterus 5 / 38063 5 / 133582 301 / 10193077 -- 5 / 38063 5 / 133582 301 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 284 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 284 / 13135050 --
white blood cells -- -- 12 / 846268 -- -- -- 12 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --