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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.119598Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 4506 / 3316537 6994 / 2498449 439429 / 114162531 314808 / 109592465 4506 / 3316537 6994 / 2498449 439429 / 114162531 314808 / 109592465
adrenal cortex -- 26 / 9928 -- -- -- 26 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 13 / 16077 121 / 57865 -- 13 / 83577 13 / 16077 121 / 57865 -- 13 / 83577
bone marrow 41 / 14774 101 / 29891 28931 / 5047110 15212 / 4978364 41 / 14774 101 / 29891 28931 / 5047110 15212 / 4978364
brain 263 / 506301 449 / 200215 605 / 729526 7440 / 4997811 263 / 506301 449 / 200215 605 / 729526 7440 / 4997811
cartilage 23 / 15965 42 / 37226 -- 783 / 778035 23 / 15965 42 / 37226 -- 783 / 778035
cerebellum 58 / 90353   89 / 90885 3530 / 1495938 58 / 90353 0 / 0 89 / 90885 3530 / 1495938
cerebrum 100 / 198932   -- -- 100 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888 179 / 44577 -- -- 2 / 3888 179 / 44577 -- --
colon 52 / 26551 382 / 151167 57 / 98089 1104 / 643586 52 / 26551 382 / 151167 57 / 98089 1104 / 643586
ear 12 / 16130 -- -- -- 12 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1071 / 246043   -- -- 1071 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 9 / 19564 2 / 2857 -- -- 9 / 19564 2 / 2857 -- --
esophagus   9 / 17290 -- -- 0 / 270 9 / 17290 -- --
eye 215 / 128826 322 / 46440 110 / 85898 51113 / 12434232 215 / 128826 322 / 46440 110 / 85898 51113 / 12434232
gastrointestinal tract 22 / 28803 50 / 12721 28 / 45908 -- 22 / 28803 50 / 12721 28 / 45908 --
heart 66 / 76442   51 / 83063 -- 66 / 76442 0 / 1 51 / 83063 --
kidney 58 / 106627 177 / 89898 221 / 155372 50 / 100281 58 / 106627 177 / 89898 221 / 155372 50 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 78 / 96846 360 / 107249 57 / 66308 746 / 214987 78 / 96846 360 / 107249 57 / 66308 746 / 214987
lung 98 / 128150 572 / 170663 376 / 159917 327 / 159059 98 / 128150 572 / 170663 376 / 159917 327 / 159059
lymph node 33 / 62650 67 / 27007 20940 / 5278419 8676 / 4863489 33 / 62650 67 / 27007 20940 / 5278419 8676 / 4863489
lymphoreticular 208 / 17836 426 / 44303 -- -- 208 / 17836 426 / 44303 -- --
mammary gland 20 / 46553 185 / 104307 9700 / 43166038 105274 / 30312656 20 / 46553 185 / 104307 9700 / 43166038 105274 / 30312656
muscle 24 / 74039 252 / 27691 11 / 107836 49 / 61270 24 / 74039 252 / 27691 11 / 107836 49 / 61270
nervous 8 / 10333   -- -- 8 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 31 / 11462 211 / 89988 89 / 94887 223 / 179472 31 / 11462 211 / 89988 89 / 94887 223 / 179472
pancreas 18 / 7237 201 / 74930 198 / 85728 160 / 189999 18 / 7237 201 / 74930 198 / 85728 160 / 189999
pancreatic islet 304 / 96524 124 / 30072 -- -- 304 / 96524 124 / 30072 -- --
parathyroid   7 / 20557 -- -- 0 / 24 7 / 20557 -- --
peripheral nervous system 31 / 14891   -- -- 31 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 20 / 6170 -- -- -- 20 / 6170 -- -- --
pituitary gland 75 / 13260 2 / 1358 -- -- 75 / 13260 2 / 1358 -- --
placenta 166 / 241088 245 / 39531 294 / 207348 -- 166 / 241088 245 / 39531 294 / 207348 --
pooled tissue 181 / 276455   -- -- 181 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 82 / 79993 245 / 107080 564 / 266949 1342 / 491794 82 / 79993 245 / 107080 564 / 266949 1342 / 491794
retina 44 / 29438 -- 853 / 820326 106 / 88490 44 / 29438 -- 853 / 820326 106 / 88490
salivary gland   42 / 10368 -- -- 0 / 2490 42 / 10368 -- --
skin 114 / 73633 595 / 125377 215330 / 26905847 90639 / 34522313 114 / 73633 595 / 125377 215330 / 26905847 90639 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 36 / 52939   -- -- 36 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 29675 / 6230144 -- -- -- 29675 / 6230144 --
stomach 63 / 26641 112 / 65644 222 / 124767 557 / 448716 63 / 26641 112 / 65644 222 / 124767 557 / 448716
synovium   13 / 1650 -- -- 0 / 249 13 / 1650 -- --
testis 42 / 143630 219 / 100058 -- 27044 / 12372003 42 / 143630 219 / 100058 -- 27044 / 12372003
thymus 2 / 4478 1 / 165 -- -- 2 / 4478 1 / 165 -- --
thyroid 8 / 11737 94 / 32606 265 / 115938 283 / 124664 8 / 11737 94 / 32606 265 / 115938 283 / 124664
uncharacterized tissue 726 / 207932 678 / 479819 39 / 21833 137 / 51729 726 / 207932 678 / 479819 39 / 21833 137 / 51729
uterus 12 / 38063 483 / 133582 69272 / 10193077 -- 12 / 38063 483 / 133582 69272 / 10193077 --
vascular 39 / 46250 -- 60723 / 13135050 -- 39 / 46250 -- 60723 / 13135050 --
white blood cells -- -- 729 / 846268 -- -- -- 729 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --