Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.11392Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 57 / 3316537 18 / 2498449 515 / 114162531 104 / 109592465 57 / 3316537 18 / 2498449 515 / 114162531 104 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077   --   2 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 7 / 506301 12 / 200215 6 / 729526 6 / 4997811 7 / 506301 12 / 200215 6 / 729526 6 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 1 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 1 / 778035
cerebellum       24 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 24 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888   -- -- 1 / 3888 0 / 44577 -- --
colon     1 / 98089 1 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 1 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye       21 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 21 / 12434232
gastrointestinal tract 5 / 28803     -- 5 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442   1 / 83063 -- 1 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 1 / 106627 1 / 89898 1 / 155372   1 / 106627 1 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   1 / 107249     0 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 22 / 128150   2 / 159917   22 / 128150 0 / 170663 2 / 159917 0 / 159059
lymph node     6 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 6 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553   438 / 43166038 10 / 30312656 2 / 46553 0 / 104307 438 / 43166038 10 / 30312656
muscle 1 / 74039       1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta       -- 0 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 6 / 276455   -- -- 6 / 276455 0 / 0 -- --
prostate         0 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina   --     0 / 29438 -- 0 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     16 / 26905847 28 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 16 / 26905847 28 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 23 / 6230144 -- -- -- 23 / 6230144 --
stomach       1 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 12 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 12 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue   2 / 479819     0 / 207932 2 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     14 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 14 / 10193077 --
vascular   -- 7 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 7 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --