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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.109590Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 116 / 3316537 44 / 2498449 530 / 114162531 471 / 109592465 116 / 3316537 44 / 2498449 530 / 114162531 471 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 --   0 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774     12 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 12 / 4978364
brain 5 / 506301 3 / 200215 3 / 729526 23 / 4997811 5 / 506301 3 / 200215 3 / 729526 23 / 4997811
cartilage 2 / 15965   -- 3 / 778035 2 / 15965 0 / 37226 -- 3 / 778035
cerebellum       2 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 2 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888   -- -- 2 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   6 / 151167 3 / 98089 4 / 643586 0 / 26551 6 / 151167 3 / 98089 4 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 2 / 128826     84 / 12434232 2 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 84 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803   1 / 45908 -- 1 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 9 / 76442   4 / 83063 -- 9 / 76442 0 / 1 4 / 83063 --
kidney 6 / 106627 4 / 89898 2 / 155372 1 / 100281 6 / 106627 4 / 89898 2 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 6 / 107249 2 / 66308 1 / 214987 2 / 96846 6 / 107249 2 / 66308 1 / 214987
lung 4 / 128150 1 / 170663 4 / 159917 2 / 159059 4 / 128150 1 / 170663 4 / 159917 2 / 159059
lymph node         0 / 62650 0 / 27007 0 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 7 / 46553 1 / 104307 317 / 43166038 207 / 30312656 7 / 46553 1 / 104307 317 / 43166038 207 / 30312656
muscle 9 / 74039   2 / 107836   9 / 74039 0 / 27691 2 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 2 / 94887   0 / 11462 2 / 89988 2 / 94887 0 / 179472
pancreas     1 / 85728 2 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524 1 / 30072 -- -- 5 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 8 / 241088 2 / 39531 2 / 207348 -- 8 / 241088 2 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993   2 / 266949 5 / 491794 1 / 79993 0 / 107080 2 / 266949 5 / 491794
retina   -- 1 / 820326   0 / 29438 -- 1 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 6 / 73633   75 / 26905847 117 / 34522313 6 / 73633 0 / 125377 75 / 26905847 117 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 24 / 6230144 -- -- -- 24 / 6230144 --
stomach       1 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 2 / 100058 -- 7 / 12372003 1 / 143630 2 / 100058 -- 7 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606     0 / 11737 2 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 14 / 207932 8 / 479819     14 / 207932 8 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 7 / 38063 2 / 133582 59 / 10193077 -- 7 / 38063 2 / 133582 59 / 10193077 --
vascular   -- 24 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 24 / 13135050 --
white blood cells -- -- 2 / 846268 -- -- -- 2 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --