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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.109225Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 153 / 3316537 61 / 2498449 1487 / 114162531 1551 / 109592465 153 / 3316537 61 / 2498449 1487 / 114162531 1551 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     3 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 3 / 5047110 0 / 4978364
brain 23 / 506301 1 / 200215 13 / 729526 171 / 4997811 23 / 506301 1 / 200215 13 / 729526 171 / 4997811
cartilage 9 / 15965 3 / 37226 -- 20 / 778035 9 / 15965 3 / 37226 -- 20 / 778035
cerebellum 1 / 90353     1 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 1 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   1 / 151167     0 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 4 / 128826     35 / 12434232 4 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 35 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 4 / 76442   1 / 83063 -- 4 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 14 / 106627 8 / 89898     14 / 106627 8 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 2 / 107249 3 / 66308 2 / 214987 1 / 96846 2 / 107249 3 / 66308 2 / 214987
lung 4 / 128150 7 / 170663 6 / 159917   4 / 128150 7 / 170663 6 / 159917 0 / 159059
lymph node   1 / 27007 100 / 5278419 43 / 4863489 0 / 62650 1 / 27007 100 / 5278419 43 / 4863489
lymphoreticular 4 / 17836   -- -- 4 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 3 / 104307 742 / 43166038 952 / 30312656 2 / 46553 3 / 104307 742 / 43166038 952 / 30312656
muscle       1 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     18 / 94887 5 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 18 / 94887 5 / 179472
pancreas 2 / 7237 2 / 74930   5 / 189999 2 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524 2 / 30072 -- -- 3 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 15 / 241088   5 / 207348 -- 15 / 241088 0 / 39531 5 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 1 / 107080   1 / 491794 4 / 79993 1 / 107080 0 / 266949 1 / 491794
retina   -- 3 / 820326   0 / 29438 -- 3 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 324 / 26905847 307 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 324 / 26905847 307 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 37 / 52939   -- -- 37 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 5 / 6230144 -- -- -- 5 / 6230144 --
stomach   3 / 65644 1 / 124767 5 / 448716 0 / 26641 3 / 65644 1 / 124767 5 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis   9 / 100058 -- 2 / 12372003 0 / 143630 9 / 100058 -- 2 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 8 / 207932 10 / 479819   1 / 51729 8 / 207932 10 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 1 / 38063 1 / 133582 230 / 10193077 -- 1 / 38063 1 / 133582 230 / 10193077 --
vascular 3 / 46250 -- 32 / 13135050 -- 3 / 46250 -- 32 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --