Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.105642Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 182 / 3316537 142 / 2498449 8378 / 114162531 4675 / 109592465 182 / 3316537 142 / 2498449 8378 / 114162531 4675 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 --   0 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     165 / 5047110 443 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 165 / 5047110 443 / 4978364
brain 21 / 506301 16 / 200215 120 / 729526 507 / 4997811 21 / 506301 16 / 200215 120 / 729526 507 / 4997811
cartilage 3 / 15965 3 / 37226 -- 16 / 778035 3 / 15965 3 / 37226 -- 16 / 778035
cerebellum 9 / 90353   22 / 90885 181 / 1495938 9 / 90353 0 / 0 22 / 90885 181 / 1495938
cerebrum 11 / 198932   -- -- 11 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon   7 / 151167 1 / 98089 19 / 643586 0 / 26551 7 / 151167 1 / 98089 19 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 19 / 246043   -- -- 19 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 9 / 128826 4 / 46440 4 / 85898 522 / 12434232 9 / 128826 4 / 46440 4 / 85898 522 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721 4 / 45908 -- 1 / 28803 1 / 12721 4 / 45908 --
heart 6 / 76442   2 / 83063 -- 6 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 5 / 106627   5 / 155372   5 / 106627 0 / 89898 5 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 4 / 96846 19 / 107249   16 / 214987 4 / 96846 19 / 107249 0 / 66308 16 / 214987
lung 4 / 128150 15 / 170663 8 / 159917 8 / 159059 4 / 128150 15 / 170663 8 / 159917 8 / 159059
lymph node 4 / 62650 1 / 27007 297 / 5278419 27 / 4863489 4 / 62650 1 / 27007 297 / 5278419 27 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 4 / 104307 5227 / 43166038 1201 / 30312656 3 / 46553 4 / 104307 5227 / 43166038 1201 / 30312656
muscle 5 / 74039 1 / 27691 4 / 107836 5 / 61270 5 / 74039 1 / 27691 4 / 107836 5 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 1 / 89988 6 / 94887 10 / 179472 1 / 11462 1 / 89988 6 / 94887 10 / 179472
pancreas   7 / 74930 12 / 85728 6 / 189999 0 / 7237 7 / 74930 12 / 85728 6 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524   -- -- 3 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 21 / 241088   17 / 207348 -- 21 / 241088 0 / 39531 17 / 207348 --
pooled tissue 16 / 276455   -- -- 16 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 3 / 107080 8 / 266949 12 / 491794 5 / 79993 3 / 107080 8 / 266949 12 / 491794
retina 1 / 29438 -- 73 / 820326 4 / 88490 1 / 29438 -- 73 / 820326 4 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 9 / 73633 5 / 125377 600 / 26905847 1284 / 34522313 9 / 73633 5 / 125377 600 / 26905847 1284 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 90 / 6230144 -- -- -- 90 / 6230144 --
stomach     19 / 124767 32 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 19 / 124767 32 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 6 / 100058 -- 377 / 12372003 1 / 143630 6 / 100058 -- 377 / 12372003
thymus 3 / 4478   -- -- 3 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 7 / 11737 1 / 32606 5 / 115938 2 / 124664 7 / 11737 1 / 32606 5 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 33 / 479819   3 / 51729 3 / 207932 33 / 479819 0 / 21833 3 / 51729
uterus 1 / 38063 7 / 133582 1357 / 10193077 -- 1 / 38063 7 / 133582 1357 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 312 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 312 / 13135050 --
white blood cells -- -- 20 / 846268 -- -- -- 20 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --