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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.105465Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 142 / 3316537 117 / 2498449 4178 / 114162531 9140 / 109592465 142 / 3316537 117 / 2498449 4178 / 114162531 9140 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   5 / 57865 --   0 / 16077 5 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   3 / 29891 329 / 5047110 445 / 4978364 0 / 14774 3 / 29891 329 / 5047110 445 / 4978364
brain 5 / 506301 3 / 200215 31 / 729526 313 / 4997811 5 / 506301 3 / 200215 31 / 729526 313 / 4997811
cartilage 1 / 15965   -- 23 / 778035 1 / 15965 0 / 37226 -- 23 / 778035
cerebellum     1 / 90885 126 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 126 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 5 / 151167 6 / 98089 69 / 643586 1 / 26551 5 / 151167 6 / 98089 69 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 44 / 246043   -- -- 44 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564 1 / 2857 -- -- 1 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 4 / 128826   2 / 85898 898 / 12434232 4 / 128826 0 / 46440 2 / 85898 898 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 4 / 76442   4 / 83063 -- 4 / 76442 0 / 1 4 / 83063 --
kidney   3 / 89898 10 / 155372 12 / 100281 0 / 106627 3 / 89898 10 / 155372 12 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 10 / 96846 14 / 107249 3 / 66308 11 / 214987 10 / 96846 14 / 107249 3 / 66308 11 / 214987
lung 3 / 128150 5 / 170663 8 / 159917 11 / 159059 3 / 128150 5 / 170663 8 / 159917 11 / 159059
lymph node     147 / 5278419 337 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 147 / 5278419 337 / 4863489
lymphoreticular 3 / 17836 12 / 44303 -- -- 3 / 17836 12 / 44303 -- --
mammary gland   16 / 104307 668 / 43166038 2011 / 30312656 0 / 46553 16 / 104307 668 / 43166038 2011 / 30312656
muscle 3 / 74039 2 / 27691   1 / 61270 3 / 74039 2 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   4 / 89988 9 / 94887 11 / 179472 0 / 11462 4 / 89988 9 / 94887 11 / 179472
pancreas   7 / 74930 5 / 85728 24 / 189999 0 / 7237 7 / 74930 5 / 85728 24 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 6 / 13260   -- -- 6 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 2 / 241088 6 / 39531 4 / 207348 -- 2 / 241088 6 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 33 / 276455   -- -- 33 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 11 / 107080 17 / 266949 62 / 491794 4 / 79993 11 / 107080 17 / 266949 62 / 491794
retina 1 / 29438 -- 4 / 820326 11 / 88490 1 / 29438 -- 4 / 820326 11 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   6 / 125377 560 / 26905847 1687 / 34522313 0 / 73633 6 / 125377 560 / 26905847 1687 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1194 / 6230144 -- -- -- 1194 / 6230144 --
stomach   1 / 65644 2 / 124767 27 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 2 / 124767 27 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630 1 / 100058 -- 3053 / 12372003 4 / 143630 1 / 100058 -- 3053 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     4 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 4 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 5 / 207932 7 / 479819 3 / 21833 7 / 51729 5 / 207932 7 / 479819 3 / 21833 7 / 51729
uterus 2 / 38063 4 / 133582 272 / 10193077 -- 2 / 38063 4 / 133582 272 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 864 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 864 / 13135050 --
white blood cells -- -- 31 / 846268 -- -- -- 31 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --