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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.102798Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 393 / 3316537 352 / 2498449 8560 / 114162531 10053 / 109592465 393 / 3316537 352 / 2498449 8560 / 114162531 10053 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 9 / 57865 -- 25 / 83577 1 / 16077 9 / 57865 -- 25 / 83577
bone marrow 3 / 14774 15 / 29891 300 / 5047110 494 / 4978364 3 / 14774 15 / 29891 300 / 5047110 494 / 4978364
brain 30 / 506301 28 / 200215 62 / 729526 366 / 4997811 30 / 506301 28 / 200215 62 / 729526 366 / 4997811
cartilage 1 / 15965 3 / 37226 -- 125 / 778035 1 / 15965 3 / 37226 -- 125 / 778035
cerebellum 10 / 90353   5 / 90885 84 / 1495938 10 / 90353 0 / 0 5 / 90885 84 / 1495938
cerebrum 9 / 198932   -- -- 9 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   9 / 44577 -- -- 0 / 3888 9 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 23 / 151167 10 / 98089 106 / 643586 2 / 26551 23 / 151167 10 / 98089 106 / 643586
ear 5 / 16130 -- -- -- 5 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 41 / 246043   -- -- 41 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 13 / 128826 4 / 46440 4 / 85898 1124 / 12434232 13 / 128826 4 / 46440 4 / 85898 1124 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803 6 / 12721 3 / 45908 -- 4 / 28803 6 / 12721 3 / 45908 --
heart 11 / 76442   6 / 83063 -- 11 / 76442 0 / 1 6 / 83063 --
kidney 8 / 106627 9 / 89898 18 / 155372 1 / 100281 8 / 106627 9 / 89898 18 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 20 / 96846 28 / 107249 2 / 66308 5 / 214987 20 / 96846 28 / 107249 2 / 66308 5 / 214987
lung 9 / 128150 20 / 170663 10 / 159917 42 / 159059 9 / 128150 20 / 170663 10 / 159917 42 / 159059
lymph node 1 / 62650 4 / 27007 322 / 5278419 189 / 4863489 1 / 62650 4 / 27007 322 / 5278419 189 / 4863489
lymphoreticular   9 / 44303 -- -- 0 / 17836 9 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 3 / 104307 2363 / 43166038 4168 / 30312656 1 / 46553 3 / 104307 2363 / 43166038 4168 / 30312656
muscle 22 / 74039 6 / 27691 7 / 107836 3 / 61270 22 / 74039 6 / 27691 7 / 107836 3 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 13 / 89988 16 / 94887 29 / 179472 3 / 11462 13 / 89988 16 / 94887 29 / 179472
pancreas 2 / 7237 6 / 74930 16 / 85728 42 / 189999 2 / 7237 6 / 74930 16 / 85728 42 / 189999
pancreatic islet 17 / 96524 4 / 30072 -- -- 17 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 36 / 241088 7 / 39531 4 / 207348 -- 36 / 241088 7 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 38 / 276455   -- -- 38 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 13 / 79993 21 / 107080 30 / 266949 91 / 491794 13 / 79993 21 / 107080 30 / 266949 91 / 491794
retina   -- 22 / 820326 4 / 88490 0 / 29438 -- 22 / 820326 4 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 7 / 73633 26 / 125377 1145 / 26905847 1453 / 34522313 7 / 73633 26 / 125377 1145 / 26905847 1453 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1446 / 6230144 -- -- -- 1446 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 11 / 65644 5 / 124767 32 / 448716 3 / 26641 11 / 65644 5 / 124767 32 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 6 / 143630 16 / 100058 -- 1662 / 12372003 6 / 143630 16 / 100058 -- 1662 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     4 / 115938 5 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 4 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 50 / 207932 39 / 479819 5 / 21833 3 / 51729 50 / 207932 39 / 479819 5 / 21833 3 / 51729
uterus 8 / 38063 28 / 133582 541 / 10193077 -- 8 / 38063 28 / 133582 541 / 10193077 --
vascular 10 / 46250 -- 2110 / 13135050 -- 10 / 46250 -- 2110 / 13135050 --
white blood cells -- -- 104 / 846268 -- -- -- 104 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --