Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
SAGE Genie
  • Human SAGE Genie Tools
  • Downloads
  • Digital Karyotyping
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


SAGE Expression Matrix

Mouse Atlas Developmental Libraries

Search query: GATTCCACTG

Color Code dot2minus dot4minus dot8minus dot16minus dot32minus dot64minus dot128minus dot256minus dot512minus dot512plus
Tags per 200,000 <2 <4 <8 <16 <32 <64 <128 <256 <512 >512

Collapse all tissues

DEVELOPMENT: dpc
0 0.5 2.5 3.5 5.5 6.5 7 7.5 8 8.5 9 9.5 10.5 11.5 12.5 13.5 14.5 15.5 16.5 17.5 18.5 20 21 27 40 41 47 55 56 62 80 83 90 92 104 129
DEVELOPMENT: Theiler Stage & days post natal
cell 1 3 5 7 9 10 11 12 13 14 15 17 19 20 21 22 23 24 25 26 27 1d 7d 20d 21d 27d 35d 36d 42d 60d 63d 70d 72d 12w 109d
Early embryo                                                                  
Embryo                                                                
  Anterior
  half
                                                                     
  Embryonic                                                                      
  Extraembryonic                                                                      
  Posterior                                                                      
  Whole                                                                      
Ectoplacental cone                                                                      
Adrenal gland                                                                    
Bladder                                                                  
Bone                                                                      
Brain                                            
  Amygdala                                                                  
  Basal nucleus
  of Meynert
                                                                     
  Ca1                                                                  
  Cerebellum                                                                      
  Cerebellum
  White Matter
                                                                     
  Dentate gyrus                                                                  
  Diencephalon                                                                      
  Dorsal
  Thalamus
                                                                     
  Epithalamus                                                                      
  Ependdymal
  layers
                                                                     
  Future brain                                                                      
  Future
  forebrain
                                                                     
  Hypothalamus                                                                    
  Locus
  coeruleus
                                                                     
  Medial
  Thalamus
                                                                     
  Preplate                                                                      
  Prestriatum                                                                      
  Primary
  motor cortex
                                                                     
  Rahpe nuclei                                                                      
  Striatum                                                                
  Substantia
  nigra
                                                                     
  Telencephalon                                                                      
  Telencephalon
  dorsal
                                                                     
  Telencephalon
  dorsal svz
                                                                     
  Telencephalon
  ventral
                                                                     
  Telencephalon
  ventral svz
                                                                     
  Ventral
  Thalamus
                                                                     
  Visual cortex                                                                
  Visual cortex
  Layers II
                                                                     
  VZ                                                                  
  Whole                                                              
  Whole Head                                                                    
Embryonic stem cell                                                                      
Embryonic tissue                                                                  
  Branchial
  arch
                                                                   
  Foregut
  endoderm
                                                                     
  Hindgut
  endoderm
                                                                     
  Urogenital
  sinus (F)
                                                                     
  Urogenital
  sinus (M)
                                                                     
  Urogenital
  sinus (M)
  epithelium
                                                                     
  Urogenital
  sinus (M)
  mesenchyme
                                                                     
Endoderm definitive                                                                      
Esophagus                                                                    
Eye, optic cup                                                                      
Forelimb                                                                  
Forelimb paddle                                                                      
Heart                                                            
  Whole                                                                      
  Atrioventricular
  canal
                                                                     
  Atrium                                                                  
  Bulbous cordis                                                                      
  Ventricle                                                                  
Kidney                                                              
  Epithelium                                                                      
  Mesenchyme                                                                      
  Whole                                                                      
Large intestine                                                                    
  Epithelium                                                                      
  Mesenchyme                                                                      
  Whole                                                                      
Liver                                                                
  Liver bud                                                                      
  Right lobe                                                                      
  Whole                                                                      
Lung                                                              
  Epithelium                                                                      
  Mesenchyme                                                                      
  Whole                                                                      
Lymph nodes                                                                    
  Lumbar                                                                      
  Mesenteric                                                                      
Mammary gland                                                                    
  Involuting                                                                      
  Lactation                                                                      
  Pregnant                                                                      
  Puberty                                                                      
Muscle                                                                      
  Skeletal                                                                      
Neural tube                                                                      
  Anterior
  Neuropore
                                                                     
  Posterior
  Neuropore
                                                                     
  Whole                                                                      
Ovary                                                                  
Pancreas                                                      
  Pancretic
  duct
                                                                     
  Regenerating
  duct
                                                                     
  Islet                                                                      
  Regenerating
  islet
                                                                     
  Whole                                                                
Pituitary                                                                  
Placenta                                                                    
Prostate                                                                  
  Dorsal                                                                      
  Dorsal lobe                                                                      
  Whole                                                                      
Skin                                                                  
Small intestine                                                                    
  Epithelium                                                                      
  Mesenchyme                                                                      
  Whole                                                                      
Spleen                                                                
Stomach                                                                    
Testis                                                              
Thymus                                                                  
Uterus                                                                    
 DEVELOPMENT: Theiler Stage & days post natal
cell 1 3 5 7 9 10 11 12 13 14 15 17 19 20 21 22 23 24 25 26 27 1d 7d 20d 21d 27d 35d 36d 42d 60d 63d 70d 72d 12w 109d
DEVELOPMENT: dpc
0 0.5 2.5 3.5 5.5 6.5 7 7.5 8 8.5 9 9.5 10.5 11.5 12.5 13.5 14.5 15.5 16.5 17.5 18.5 20 21 27 40 41 47 55 56 62 80 83 90 92 104 129