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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.87202Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 4 / 3316537 13 / 2498449 62 / 114162531 45 / 109592465 4 / 3316537 13 / 2498449 62 / 114162531 45 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     9 / 5047110 15 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 9 / 5047110 15 / 4978364
brain   3 / 200215   5 / 4997811 0 / 506301 3 / 200215 0 / 729526 5 / 4997811
cartilage     --   0 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum       2 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 2 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon       1 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye         0 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 0 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney         0 / 106627 0 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung   1 / 170663     0 / 128150 1 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node     2 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 2 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     26 / 43166038 6 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 26 / 43166038 6 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary       1 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta       -- 0 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993     2 / 491794 1 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 2 / 491794
retina   -- 1 / 820326   0 / 29438 -- 1 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     14 / 26905847 12 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 14 / 26905847 12 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 2 / 6230144 -- -- -- 2 / 6230144 --
stomach         0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 1 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 1 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue   9 / 479819     0 / 207932 9 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     6 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 6 / 10193077 --
vascular   -- 2 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 2 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --