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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.454528Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 648 / 3316537 393 / 2498449 1470 / 114162531 1893 / 109592465 648 / 3316537 393 / 2498449 1470 / 114162531 1893 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 7 / 57865 --   1 / 16077 7 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 3 / 29891 6 / 5047110   1 / 14774 3 / 29891 6 / 5047110 0 / 4978364
brain 166 / 506301 17 / 200215 42 / 729526 300 / 4997811 166 / 506301 17 / 200215 42 / 729526 300 / 4997811
cartilage 9 / 15965 6 / 37226 -- 101 / 778035 9 / 15965 6 / 37226 -- 101 / 778035
cerebellum 22 / 90353   5 / 90885 160 / 1495938 22 / 90353 0 / 0 5 / 90885 160 / 1495938
cerebrum 71 / 198932   -- -- 71 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   8 / 44577 -- -- 0 / 3888 8 / 44577 -- --
colon 7 / 26551 17 / 151167 2 / 98089 30 / 643586 7 / 26551 17 / 151167 2 / 98089 30 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 31 / 246043   -- -- 31 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564 1 / 2857 -- -- 2 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   7 / 17290 -- -- 0 / 270 7 / 17290 -- --
eye 20 / 128826 2 / 46440 5 / 85898 343 / 12434232 20 / 128826 2 / 46440 5 / 85898 343 / 12434232
gastrointestinal tract 6 / 28803 4 / 12721 2 / 45908 -- 6 / 28803 4 / 12721 2 / 45908 --
heart 14 / 76442   9 / 83063 -- 14 / 76442 0 / 1 9 / 83063 --
kidney 17 / 106627 16 / 89898 6 / 155372 1 / 100281 17 / 106627 16 / 89898 6 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 8 / 96846 23 / 107249   13 / 214987 8 / 96846 23 / 107249 0 / 66308 13 / 214987
lung 25 / 128150 19 / 170663 6 / 159917 7 / 159059 25 / 128150 19 / 170663 6 / 159917 7 / 159059
lymph node 5 / 62650 11 / 27007 143 / 5278419 27 / 4863489 5 / 62650 11 / 27007 143 / 5278419 27 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 4 / 44303 -- -- 1 / 17836 4 / 44303 -- --
mammary gland 7 / 46553 18 / 104307 494 / 43166038 256 / 30312656 7 / 46553 18 / 104307 494 / 43166038 256 / 30312656
muscle 1 / 74039 2 / 27691   3 / 61270 1 / 74039 2 / 27691 0 / 107836 3 / 61270
nervous 5 / 10333   -- -- 5 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   6 / 89988 5 / 94887 4 / 179472 0 / 11462 6 / 89988 5 / 94887 4 / 179472
pancreas   8 / 74930 3 / 85728 10 / 189999 0 / 7237 8 / 74930 3 / 85728 10 / 189999
pancreatic islet 10 / 96524 4 / 30072 -- -- 10 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid   6 / 20557 -- -- 0 / 24 6 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 27 / 241088 7 / 39531 6 / 207348 -- 27 / 241088 7 / 39531 6 / 207348 --
pooled tissue 25 / 276455   -- -- 25 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 12 / 79993 18 / 107080 10 / 266949 20 / 491794 12 / 79993 18 / 107080 10 / 266949 20 / 491794
retina 1 / 29438 -- 55 / 820326 1 / 88490 1 / 29438 -- 55 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 22 / 73633 16 / 125377 216 / 26905847 331 / 34522313 22 / 73633 16 / 125377 216 / 26905847 331 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 17 / 52939   -- -- 17 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 93 / 6230144 -- -- -- 93 / 6230144 --
stomach 4 / 26641 4 / 65644 22 / 124767 41 / 448716 4 / 26641 4 / 65644 22 / 124767 41 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 41 / 143630 31 / 100058 -- 230 / 12372003 41 / 143630 31 / 100058 -- 230 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 5 / 32606 8 / 115938 12 / 124664 2 / 11737 5 / 32606 8 / 115938 12 / 124664
uncharacterized tissue 36 / 207932 89 / 479819   3 / 51729 36 / 207932 89 / 479819 0 / 21833 3 / 51729
uterus 14 / 38063 34 / 133582 192 / 10193077 -- 14 / 38063 34 / 133582 192 / 10193077 --
vascular 12 / 46250 -- 130 / 13135050 -- 12 / 46250 -- 130 / 13135050 --
white blood cells -- -- 10 / 846268 -- -- -- 10 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --