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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.132954Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 48 / 3316537 7 / 2498449 36 / 114162531 72 / 109592465 48 / 3316537 7 / 2498449 36 / 114162531 72 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow       5 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 5 / 4978364
brain 14 / 506301   1 / 729526 4 / 4997811 14 / 506301 0 / 200215 1 / 729526 4 / 4997811
cartilage     -- 1 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 1 / 778035
cerebellum 4 / 90353       4 / 90353 0 / 0 0 / 90885 0 / 1495938
cerebrum 13 / 198932   -- -- 13 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon         0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 2 / 128826       2 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 0 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney   1 / 89898     0 / 106627 1 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung         0 / 128150 0 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node         0 / 62650 0 / 27007 0 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     1 / 43166038 22 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 1 / 43166038 22 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 2 / 241088     -- 2 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 3 / 276455   -- -- 3 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993       2 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina 2 / 29438 -- 1 / 820326   2 / 29438 -- 1 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     26 / 26905847 24 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 26 / 26905847 24 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 6230144 --
stomach   1 / 65644     0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630   -- 15 / 12372003 5 / 143630 0 / 100058 -- 15 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue   4 / 479819   1 / 51729 0 / 207932 4 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus   1 / 133582 6 / 10193077 -- 0 / 38063 1 / 133582 6 / 10193077 --
vascular   --   -- 0 / 46250 -- 0 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --